MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 38750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009440	CA	3	6	228317	228322	50 %	0 %	0 %	50 %	146303055
4002	NC_009440	TCA	2	6	228351	228356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303055
4003	NC_009440	TCC	2	6	228406	228411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303055
4004	NC_009440	CGC	2	6	228440	228445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146303055
4005	NC_009440	CCT	2	6	228449	228454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303055
4006	NC_009440	CTC	2	6	228492	228497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303056
4007	NC_009440	CCCT	2	8	228548	228555	0 %	25 %	0 %	75 %	146303056
4008	NC_009440	CCCT	2	8	228625	228632	0 %	25 %	0 %	75 %	146303056
4009	NC_009440	TCCC	2	8	228670	228677	0 %	25 %	0 %	75 %	146303056
4010	NC_009440	ATC	2	6	228745	228750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303056
4011	NC_009440	GGA	2	6	228808	228813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303056
4012	NC_009440	GACCAC	2	12	228943	228954	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	146303056
4013	NC_009440	ACA	2	6	229001	229006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303056
4014	NC_009440	GA	3	6	229016	229021	50 %	0 %	50 %	0 %	146303056
4015	NC_009440	TCC	2	6	229025	229030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303056
4016	NC_009440	TTA	2	6	229089	229094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303056
4017	NC_009440	TCC	2	6	229109	229114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303056
4018	NC_009440	TCG	2	6	229143	229148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303056
4019	NC_009440	ACC	2	6	229271	229276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303056
4020	NC_009440	ACG	2	6	229277	229282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303056
4021	NC_009440	CTC	2	6	229368	229373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303056
4022	NC_009440	TCC	2	6	229424	229429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303056
4023	NC_009440	CGT	2	6	229479	229484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303056
4024	NC_009440	CT	3	6	229491	229496	0 %	50 %	0 %	50 %	146303056
4025	NC_009440	AGC	2	6	229498	229503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303056
4026	NC_009440	CAT	2	6	229510	229515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303056
4027	NC_009440	GA	3	6	229526	229531	50 %	0 %	50 %	0 %	146303056
4028	NC_009440	ACC	2	6	229557	229562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303056
4029	NC_009440	TA	3	6	229621	229626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_009440	A	6	6	229675	229680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_009440	TCT	2	6	229711	229716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303057
4032	NC_009440	ATT	2	6	229732	229737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303057
4033	NC_009440	TCCC	2	8	229755	229762	0 %	25 %	0 %	75 %	146303057
4034	NC_009440	GC	3	6	229792	229797	0 %	0 %	50 %	50 %	146303057
4035	NC_009440	ATCCC	2	10	229820	229829	20 %	20 %	0 %	60 %	146303057
4036	NC_009440	ACC	2	6	229855	229860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303057
4037	NC_009440	GAG	2	6	229876	229881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303057
4038	NC_009440	AAC	2	6	229996	230001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303057
4039	NC_009440	GCCT	2	8	230041	230048	0 %	25 %	25 %	50 %	146303057
4040	NC_009440	CCT	2	6	230069	230074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303057
4041	NC_009440	CCTA	2	8	230121	230128	25 %	25 %	0 %	50 %	146303057
4042	NC_009440	TTA	2	6	230144	230149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303057
4043	NC_009440	TCG	2	6	230290	230295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303057
4044	NC_009440	GCTC	2	8	230429	230436	0 %	25 %	25 %	50 %	146303057
4045	NC_009440	TCT	2	6	230471	230476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303057
4046	NC_009440	TCC	2	6	230578	230583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303057
4047	NC_009440	GTG	2	6	230616	230621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303057
4048	NC_009440	CCT	2	6	230718	230723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303057
4049	NC_009440	GT	3	6	230844	230849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_009440	CA	3	6	230923	230928	50 %	0 %	0 %	50 %	146303058
4051	NC_009440	AAGG	2	8	231015	231022	50 %	0 %	50 %	0 %	146303058
4052	NC_009440	AGG	2	6	231056	231061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303058
4053	NC_009440	AAC	2	6	231118	231123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303058
4054	NC_009440	AGCCT	2	10	231460	231469	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4055	NC_009440	TCA	2	6	231523	231528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303059
4056	NC_009440	CAT	2	6	231626	231631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303059
4057	NC_009440	CAT	2	6	231725	231730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303059
4058	NC_009440	GAG	2	6	231749	231754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303059
4059	NC_009440	TGG	2	6	231823	231828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303059
4060	NC_009440	GCAC	2	8	231893	231900	25 %	0 %	25 %	50 %	146303059
4061	NC_009440	CTA	2	6	231904	231909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303059
4062	NC_009440	CCAT	2	8	231930	231937	25 %	25 %	0 %	50 %	146303059
4063	NC_009440	GTA	2	6	231941	231946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303059
4064	NC_009440	TCC	2	6	232145	232150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303059
4065	NC_009440	TCT	2	6	232189	232194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303059
4066	NC_009440	TGG	2	6	232225	232230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303059
4067	NC_009440	TCC	2	6	232259	232264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303059
4068	NC_009440	AGG	2	6	232383	232388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303059
4069	NC_009440	ACC	2	6	232472	232477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303059
4070	NC_009440	GGA	2	6	232514	232519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303059
4071	NC_009440	CTT	2	6	232523	232528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303059
4072	NC_009440	CT	3	6	232550	232555	0 %	50 %	0 %	50 %	146303059
4073	NC_009440	TCC	3	9	232626	232634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303059
4074	NC_009440	ATTAT	2	10	232655	232664	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_009440	GAT	2	6	232688	232693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_009440	TCT	2	6	232731	232736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_009440	TAG	2	6	232804	232809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_009440	TAT	2	6	232913	232918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_009440	TGATAA	2	12	232960	232971	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_009440	AT	4	8	232972	232979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_009440	ATA	2	6	233000	233005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303060
4082	NC_009440	CAG	2	6	233038	233043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303060
4083	NC_009440	TGGA	2	8	233094	233101	25 %	25 %	50 %	0 %	146303060
4084	NC_009440	ATC	2	6	233165	233170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303060
4085	NC_009440	AGCC	2	8	233323	233330	25 %	0 %	25 %	50 %	146303060
4086	NC_009440	CAT	2	6	233365	233370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303060
4087	NC_009440	GAA	2	6	233394	233399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303060
4088	NC_009440	CAC	2	6	233454	233459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303060
4089	NC_009440	GACA	2	8	233492	233499	50 %	0 %	25 %	25 %	146303060
4090	NC_009440	GAA	2	6	233563	233568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303060
4091	NC_009440	ACG	2	6	233583	233588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303060
4092	NC_009440	TCC	2	6	233598	233603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303060
4093	NC_009440	GAGG	2	8	233621	233628	25 %	0 %	75 %	0 %	146303060
4094	NC_009440	ATC	2	6	233630	233635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303060
4095	NC_009440	C	6	6	233638	233643	0 %	0 %	0 %	100 %	146303060
4096	NC_009440	GAA	2	6	233680	233685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303060
4097	NC_009440	CAGGA	2	10	233728	233737	40 %	0 %	40 %	20 %	146303060
4098	NC_009440	GTG	2	6	233825	233830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303060
4099	NC_009440	GAG	2	6	233833	233838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303060
4100	NC_009440	AGG	2	6	233925	233930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303060
4101	NC_009440	GGA	2	6	234010	234015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303060
4102	NC_009440	GA	3	6	234055	234060	50 %	0 %	50 %	0 %	146303060
4103	NC_009440	GAG	2	6	234074	234079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303060
4104	NC_009440	GAG	2	6	234097	234102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303060
4105	NC_009440	AGT	2	6	234145	234150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303060
4106	NC_009440	TCC	2	6	234160	234165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303060
4107	NC_009440	GAA	2	6	234179	234184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303060
4108	NC_009440	TAA	2	6	234207	234212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303060
4109	NC_009440	ATAG	2	8	234221	234228	50 %	25 %	25 %	0 %	146303060
4110	NC_009440	AAC	2	6	234313	234318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303061
4111	NC_009440	GA	4	8	234335	234342	50 %	0 %	50 %	0 %	146303061
4112	NC_009440	GGA	2	6	234358	234363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303061
4113	NC_009440	AAGG	2	8	234370	234377	50 %	0 %	50 %	0 %	146303061
4114	NC_009440	TGG	2	6	234457	234462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303061
4115	NC_009440	GAG	2	6	234491	234496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303061
4116	NC_009440	CCCT	2	8	234512	234519	0 %	25 %	0 %	75 %	146303061
4117	NC_009440	CTT	3	9	234526	234534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303061
4118	NC_009440	G	6	6	234572	234577	0 %	0 %	100 %	0 %	146303061
4119	NC_009440	GA	3	6	234590	234595	50 %	0 %	50 %	0 %	146303061
4120	NC_009440	AAG	2	6	234692	234697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303061
4121	NC_009440	CGG	2	6	234703	234708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146303061
4122	NC_009440	AGA	2	6	234726	234731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303061
4123	NC_009440	TATT	2	8	234732	234739	25 %	75 %	0 %	0 %	146303061
4124	NC_009440	ATT	2	6	234764	234769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303061
4125	NC_009440	TCG	3	9	234825	234833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303061
4126	NC_009440	GAG	2	6	234935	234940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303061
4127	NC_009440	CAA	2	6	235118	235123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303061
4128	NC_009440	AAC	2	6	235150	235155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303061
4129	NC_009440	GGCT	2	8	235177	235184	0 %	25 %	50 %	25 %	146303061
4130	NC_009440	GCC	2	6	235223	235228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146303061
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4133	NC_009440	CGG	2	6	235294	235299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146303061
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4137	NC_009440	GAC	2	6	235504	235509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303062
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4154	NC_009440	TCG	2	6	236701	236706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303062
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4211	NC_009440	AT	3	6	239894	239899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4212	NC_009440	TAT	2	6	239901	239906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303065
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4231	NC_009440	TGC	2	6	240853	240858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303066
4232	NC_009440	CT	4	8	240924	240931	0 %	50 %	0 %	50 %	146303066
4233	NC_009440	GTA	2	6	240947	240952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303066
4234	NC_009440	GCA	2	6	240962	240967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303066
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4238	NC_009440	CTT	2	6	241469	241474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4239	NC_009440	T	7	7	241473	241479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4240	NC_009440	CTT	2	6	241507	241512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4241	NC_009440	GAA	2	6	241525	241530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303067
4242	NC_009440	ATG	2	6	241554	241559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303067
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4244	NC_009440	TC	3	6	241634	241639	0 %	50 %	0 %	50 %	146303067
4245	NC_009440	TTC	2	6	241644	241649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303067
4246	NC_009440	TCA	2	6	241653	241658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303067
4247	NC_009440	TGT	2	6	241671	241676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303067
4248	NC_009440	CT	3	6	241711	241716	0 %	50 %	0 %	50 %	146303067
4249	NC_009440	TC	3	6	241732	241737	0 %	50 %	0 %	50 %	146303067
4250	NC_009440	TCC	2	6	241787	241792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303067
4251	NC_009440	TGG	2	6	241797	241802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303067
4252	NC_009440	CAG	2	6	241817	241822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303067
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4259	NC_009440	CATT	2	8	242373	242380	25 %	50 %	0 %	25 %	146303068
4260	NC_009440	CT	3	6	242395	242400	0 %	50 %	0 %	50 %	146303068
4261	NC_009440	CAGC	2	8	242442	242449	25 %	0 %	25 %	50 %	146303068
4262	NC_009440	TCT	2	6	242749	242754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303069
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4266	NC_009440	A	6	6	242908	242913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_009440	GTT	2	6	243287	243292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303070
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4269	NC_009440	AGA	2	6	243397	243402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303071
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4273	NC_009440	TA	3	6	243621	243626	50 %	50 %	0 %	0 %	146303071
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4277	NC_009440	ACA	2	6	243890	243895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303072
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4280	NC_009440	TCC	2	6	244125	244130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4281	NC_009440	AGG	2	6	244181	244186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303073
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4299	NC_009440	CT	3	6	245573	245578	0 %	50 %	0 %	50 %	146303074
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4307	NC_009440	AT	3	6	245934	245939	50 %	50 %	0 %	0 %	146303074
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4310	NC_009440	AAAG	2	8	246036	246043	75 %	0 %	25 %	0 %	146303075
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4313	NC_009440	CTT	2	6	246195	246200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303075
4314	NC_009440	TGA	2	6	246308	246313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303075
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4319	NC_009440	TAT	2	6	246727	246732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303075
4320	NC_009440	TAC	2	6	246760	246765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303075
4321	NC_009440	TCA	2	6	246861	246866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303075
4322	NC_009440	TACT	2	8	247107	247114	25 %	50 %	0 %	25 %	146303075
4323	NC_009440	CGT	2	6	247116	247121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303075
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4327	NC_009440	TGA	2	6	247292	247297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303075
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4331	NC_009440	ATCTGG	2	12	247476	247487	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146303075
4332	NC_009440	ATC	2	6	247488	247493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303075
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4334	NC_009440	TAA	2	6	247569	247574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303075
4335	NC_009440	AAG	2	6	247602	247607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303075
4336	NC_009440	A	7	7	247637	247643	100 %	0 %	0 %	0 %	146303076
4337	NC_009440	TAGGG	2	10	247671	247680	20 %	20 %	60 %	0 %	146303076
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4353	NC_009440	CA	3	6	248514	248519	50 %	0 %	0 %	50 %	146303076
4354	NC_009440	TTC	2	6	248536	248541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303076
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4357	NC_009440	A	6	6	248855	248860	100 %	0 %	0 %	0 %	146303076
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4362	NC_009440	T	6	6	249334	249339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4363	NC_009440	ATT	2	6	249433	249438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303077
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4368	NC_009440	AAG	2	6	249846	249851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303077
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4370	NC_009440	T	6	6	249869	249874	0 %	100 %	0 %	0 %	146303078
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4492	NC_009440	TAA	2	6	257303	257308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4493	NC_009440	CTT	2	6	257321	257326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4494	NC_009440	TA	3	6	257339	257344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4495	NC_009440	GTTAG	2	10	257364	257373	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4496	NC_009440	GATA	2	8	257375	257382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4497	NC_009440	GAG	2	6	257482	257487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4498	NC_009440	CCAG	2	8	257515	257522	25 %	0 %	25 %	50 %	146303085
4499	NC_009440	GAT	2	6	257691	257696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303085
4500	NC_009440	ATG	2	6	257759	257764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303085

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